La presencia de epidemias o pandemias de enfermedades infecciosas emergentes o re emergentes, cuya virulencia dará paso a un trabajo hospitalario excepcional, hace que la Epidemiología Hospitalaria cobre mayor relevancia, su principal labor es la de adoptar medidas de contención principalmente de riesgo biológico. Por lo que se la concibe como una especialidad de las ciencias de la salud de relevante importancia en la práctica médica en los hospitales. La atención de las enfermedades clínicas infecciosas, se ha centrado siempre en la comprensión de la epidemiología de estas enfermedades.
Además, estudia las causas de la aparición, propagación y mantenimiento de los problemas de salud en la población hospitalaria (Pacientes, personal de salud y visitas), con la finalidad de vigilarlos, prevenirlos y controlarlos.
